Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM27E3Q08E93 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM27E3Q08E93 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms