Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2orf54Q08AI8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms