Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD300CQ08708 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms