Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4CQ08493 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms