Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms