Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCDQ05655 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCDQ05655 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCDQ05655 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKCDQ05655 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms