Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIN1Q05586 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms