Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN1Q04323 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms