Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNC4Q03721 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC4Q03721 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms