Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGFBR3Q03167 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGFBR3Q03167 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms