Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms