Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPEQ02224 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPEQ02224 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms