Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFITM3Q01628 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms