Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms