Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BEX3Q00994 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms