Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTHL1P78549 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTHL1P78549 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTHL1P78549 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTHL1P78549 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NTHL1P78549 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTHL1P78549 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTHL1P78549 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTHL1P78549 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms