Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRPAP78324 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIRPAP78324 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms