Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2P78314 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP2P78314 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms