Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC1P63316 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms