Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63121 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms