Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RPS29P62273 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPS29P62273 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPS29P62273 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS29P62273 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS29P62273 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS29P62273 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS29P62273 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS29P62273 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS29P62273 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS29P62273 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS29P62273 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS29P62273 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS29P62273 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS29P62273 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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