Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1S1P61966 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms