Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ1P61923 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms