Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF3P61204 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF3P61204 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF3P61204 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF3P61204 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF3P61204 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF3P61204 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF3P61204 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF3P61204 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF3P61204 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF3P61204 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARF3P61204 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF3P61204 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF3P61204 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF3P61204 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF3P61204 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF3P61204 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF3P61204 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF3P61204 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms