Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF3P57682 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF3P57682 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF3P57682 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF3P57682 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF3P57682 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF3P57682 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF3P57682 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF3P57682 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms