Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2BFSP57053 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms