Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GSCP56915 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSCP56915 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSCP56915 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GSCP56915 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSCP56915 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSCP56915 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSCP56915 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSCP56915 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSCP56915 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSCP56915 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSCP56915 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSCP56915 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSCP56915 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSCP56915 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSCP56915 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSCP56915 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSCP56915 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSCP56915 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSCP56915 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSCP56915 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSCP56915 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSCP56915 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSCP56915 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSCP56915 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSCP56915 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSCP56915 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSCP56915 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSCP56915 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSCP56915 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSCP56915 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSCP56915 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms