Protein–RNA interactions for Protein: P56537

EIF6, Eukaryotic translation initiation factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF6P56537 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF6P56537 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF6P56537 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF6P56537 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF6P56537 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF6P56537 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF6P56537 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF6P56537 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF6P56537 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EIF6P56537 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF6P56537 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF6P56537 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF6P56537 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF6P56537 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF6P56537 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF6P56537 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF6P56537 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF6P56537 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF6P56537 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF6P56537 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF6P56537 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF6P56537 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF6P56537 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF6P56537 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF6P56537 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF6P56537 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF6P56537 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF6P56537 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF6P56537 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF6P56537 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF6P56537 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF6P56537 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF6P56537 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF6P56537 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF6P56537 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF6P56537 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF6P56537 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF6P56537 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF6P56537 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF6P56537 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF6P56537 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF6P56537 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF6P56537 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF6P56537 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF6P56537 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF6P56537 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF6P56537 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF6P56537 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF6P56537 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF6P56537 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms