Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC13P55735 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC13P55735 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC13P55735 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC13P55735 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC13P55735 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC13P55735 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC13P55735 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC13P55735 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC13P55735 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC13P55735 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC13P55735 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC13P55735 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC13P55735 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC13P55735 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC13P55735 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC13P55735 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC13P55735 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC13P55735 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC13P55735 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC13P55735 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC13P55735 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC13P55735 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC13P55735 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC13P55735 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC13P55735 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC13P55735 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC13P55735 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC13P55735 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC13P55735 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC13P55735 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC13P55735 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC13P55735 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC13P55735 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC13P55735 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC13P55735 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC13P55735 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC13P55735 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC13P55735 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC13P55735 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC13P55735 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC13P55735 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC13P55735 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC13P55735 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC13P55735 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms