Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIM2P55344 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIM2P55344 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIM2P55344 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIM2P55344 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIM2P55344 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIM2P55344 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIM2P55344 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIM2P55344 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIM2P55344 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIM2P55344 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIM2P55344 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIM2P55344 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIM2P55344 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIM2P55344 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIM2P55344 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIM2P55344 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIM2P55344 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LIM2P55344 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIM2P55344 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIM2P55344 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIM2P55344 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIM2P55344 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIM2P55344 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIM2P55344 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIM2P55344 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIM2P55344 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIM2P55344 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIM2P55344 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LIM2P55344 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIM2P55344 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIM2P55344 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LIM2P55344 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIM2P55344 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIM2P55344 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms