Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRLP54845 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRLP54845 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRLP54845 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRLP54845 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRLP54845 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRLP54845 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRLP54845 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRLP54845 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRLP54845 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRLP54845 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRLP54845 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRLP54845 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NRLP54845 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRLP54845 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRLP54845 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRLP54845 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRLP54845 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRLP54845 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRLP54845 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRLP54845 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRLP54845 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRLP54845 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRLP54845 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRLP54845 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRLP54845 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRLP54845 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRLP54845 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRLP54845 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRLP54845 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRLP54845 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRLP54845 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRLP54845 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRLP54845 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRLP54845 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRLP54845 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRLP54845 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRLP54845 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRLP54845 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms