Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB3P54753 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB3P54753 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms