Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP2S1P53680 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AP2S1P53680 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AP2S1P53680 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms