Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPAP53621 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPAP53621 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPAP53621 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPAP53621 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPAP53621 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPAP53621 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPAP53621 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPAP53621 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPAP53621 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPAP53621 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPAP53621 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPAP53621 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPAP53621 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPAP53621 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPAP53621 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPAP53621 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COPAP53621 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPAP53621 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPAP53621 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPAP53621 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPAP53621 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPAP53621 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPAP53621 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPAP53621 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPAP53621 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COPAP53621 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPAP53621 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COPAP53621 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPAP53621 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COPAP53621 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPAP53621 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPAP53621 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPAP53621 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPAP53621 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPAP53621 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPAP53621 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COPAP53621 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPAP53621 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPAP53621 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPAP53621 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPAP53621 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPAP53621 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms