Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP2P53365 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP2P53365 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms