Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMSP52788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMSP52788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMSP52788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMSP52788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMSP52788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMSP52788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMSP52788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMSP52788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMSP52788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMSP52788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMSP52788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMSP52788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMSP52788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMSP52788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMSP52788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMSP52788 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMSP52788 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms