Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGDP52209 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGDP52209 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGDP52209 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGDP52209 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGDP52209 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGDP52209 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGDP52209 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGDP52209 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGDP52209 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGDP52209 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGDP52209 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGDP52209 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGDP52209 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGDP52209 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms