Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN1P51911 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN1P51911 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN1P51911 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN1P51911 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN1P51911 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN1P51911 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN1P51911 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN1P51911 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN1P51911 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN1P51911 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN1P51911 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN1P51911 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN1P51911 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN1P51911 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN1P51911 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms