Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCR4P51679 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCR4P51679 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCR4P51679 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR4P51679 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCR4P51679 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCR4P51679 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCR4P51679 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCR4P51679 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCR4P51679 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCR4P51679 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCR4P51679 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCR4P51679 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCR4P51679 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCR4P51679 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCR4P51679 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms