Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK9P50750 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK9P50750 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK9P50750 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK9P50750 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK9P50750 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK9P50750 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK9P50750 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK9P50750 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK9P50750 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK9P50750 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK9P50750 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK9P50750 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK9P50750 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK9P50750 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK9P50750 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK9P50750 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK9P50750 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK9P50750 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK9P50750 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK9P50750 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK9P50750 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK9P50750 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms