Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBP50607 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBP50607 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBP50607 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBP50607 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBP50607 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBP50607 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBP50607 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBP50607 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBP50607 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBP50607 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBP50607 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBP50607 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBP50607 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBP50607 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBP50607 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBP50607 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBP50607 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBP50607 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBP50607 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBP50607 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBP50607 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBP50607 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms