Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRE11P49959 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRE11P49959 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRE11P49959 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRE11P49959 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRE11P49959 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRE11P49959 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRE11P49959 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRE11P49959 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MRE11P49959 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MRE11P49959 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRE11P49959 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRE11P49959 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRE11P49959 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRE11P49959 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRE11P49959 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRE11P49959 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRE11P49959 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRE11P49959 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRE11P49959 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRE11P49959 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MRE11P49959 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRE11P49959 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRE11P49959 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRE11P49959 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRE11P49959 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRE11P49959 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRE11P49959 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRE11P49959 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRE11P49959 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRE11P49959 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MRE11P49959 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRE11P49959 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRE11P49959 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms