Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK2P49760 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLK2P49760 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLK2P49760 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK2P49760 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK2P49760 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK2P49760 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK2P49760 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK2P49760 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK2P49760 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK2P49760 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK2P49760 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK2P49760 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK2P49760 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK2P49760 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK2P49760 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK2P49760 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK2P49760 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLK2P49760 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLK2P49760 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK2P49760 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK2P49760 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK2P49760 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK2P49760 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK2P49760 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK2P49760 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK2P49760 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLK2P49760 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLK2P49760 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLK2P49760 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms