Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK1P49759 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK1P49759 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK1P49759 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK1P49759 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLK1P49759 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLK1P49759 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLK1P49759 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLK1P49759 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLK1P49759 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLK1P49759 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLK1P49759 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLK1P49759 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLK1P49759 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLK1P49759 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLK1P49759 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLK1P49759 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLK1P49759 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLK1P49759 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLK1P49759 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLK1P49759 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK1P49759 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms