Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTCFP49711 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTCFP49711 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTCFP49711 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTCFP49711 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTCFP49711 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTCFP49711 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTCFP49711 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTCFP49711 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTCFP49711 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTCFP49711 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTCFP49711 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTCFP49711 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTCFP49711 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTCFP49711 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTCFP49711 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTCFP49711 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTCFP49711 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTCFP49711 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTCFP49711 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTCFP49711 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTCFP49711 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTCFP49711 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTCFP49711 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTCFP49711 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTCFP49711 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTCFP49711 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTCFP49711 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTCFP49711 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTCFP49711 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTCFP49711 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTCFP49711 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTCFP49711 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTCFP49711 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTCFP49711 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTCFP49711 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTCFP49711 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTCFP49711 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTCFP49711 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTCFP49711 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTCFP49711 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTCFP49711 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTCFP49711 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTCFP49711 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTCFP49711 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTCFP49711 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTCFP49711 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTCFP49711 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTCFP49711 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms