Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITPNBP48739 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms