Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA8P48165 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA8P48165 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA8P48165 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA8P48165 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA8P48165 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA8P48165 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJA8P48165 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJA8P48165 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJA8P48165 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA8P48165 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA8P48165 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA8P48165 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA8P48165 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA8P48165 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA8P48165 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA8P48165 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA8P48165 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA8P48165 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA8P48165 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA8P48165 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA8P48165 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA8P48165 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA8P48165 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA8P48165 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA8P48165 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA8P48165 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA8P48165 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA8P48165 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA8P48165 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA8P48165 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA8P48165 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA8P48165 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA8P48165 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA8P48165 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA8P48165 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA8P48165 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA8P48165 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA8P48165 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA8P48165 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA8P48165 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA8P48165 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA8P48165 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA8P48165 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms