Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIA4P48058 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA4P48058 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA4P48058 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms