Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKN1BP46527 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms