Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCR1P46094 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XCR1P46094 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XCR1P46094 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XCR1P46094 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
XCR1P46094 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XCR1P46094 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XCR1P46094 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XCR1P46094 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XCR1P46094 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XCR1P46094 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XCR1P46094 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms